בשנת 2002, ביונסה והראפר שון "ג'יי זי" קרטר שיתפו פעולה לראשונה בשיר:

"'03 Bonnie & Clyde" והם התחילו לצאת באותה השנה. בשנת 2008, לאחר שבע שנות זוגיות הזוג התארס בפריז, וב-4 באפריל 2008, נישא הזוג בחתונה פרטית בביתו של שון. נכון להיום הזוג שווה כביליון דולר ושניהם מכרו ביחד למעלה מ-300 מיליון תקליטים ברחבי העולם. בשנת 2010 עברה ביונסה הפלה טבעית ותארה את זה כ"דבר העצוב ביותר שקרה לה", כדי לא לשקוע בדיכאון ביונסה אמרה שהיא החלה לעבוד ולכתוב שירים לאלבומה הרביעי.

בשנת 2011 נכנסה ביונסה להריון בפריז כאשר טסה עם בעלה לשם במטרה לצלם תמונות לאלבום וב-28 באוגוסט 2011, בטקס פרסי ה-VMA הודיעה ביונסה שהיא בהריון, כאשר הופיעה עם הסינגל: "Love On Top", ובסיומו פתחה את הג'קט וחשפה את הבטן. ההכרזה הפכה במהרה לרגע הכי מצויץ בטוויטר בהיסטוריה ושברה את שיא הרייטינג של הטקס שעמד על 12.44 מיליון צופים ברגע ההכרזה. ההכרזה נכנסה לספר השיאים של גינס ב-7 בינואר 2012, נולדה בתם בלו אייבי קראטר בבית החולים "לנוקס היל" שבניו-יורק.

ב-1 בפברואר 2017, הודיעה ביונסה ברשת החברתית "אינסטגרם'' שהיא ובעלה ג׳יי זי בהריון והם מחכים לתאומים, התמונה הפכה לתמונה עם הכי הרבה לייקים באינסטגרם כאשר צברה למעלה מ-10 מיליון לייקים.

​

​

ביונסה חושפת שהיא בהריון על

הבמה (דקה 4.26)-

​

​

חיים אישיים